Infrastrukra a služby nabízené v rámci otevřeného přístupu:
| Laboratoř environmentální chemie a biochemie (LECHB) |
| Dvoudimenzionální kapalinový chromatograf s vysokorozlišujícím hmotnostním spektrometrem (QExactive) – analytický přístroj používaný k cílené analýze léčiv, pesticidů, hormonů, UV filtrů, perfluorovaných látek a dalších mikropolutantů převážně v biologických vzorcích vodních organismů a rostlin |
 |
| Dvoudimenzionální kapalinový chromatograf s vysokorozlišujícím hmotnostním spektrometrem (QExactive-HF) – analytický přístroj pro cílený a necílený screening vodního prostředí |
 |
| Dvoudimenzionální kapalinový chromatograf s hmotnostním spektrometrem na bázi trojitého kvadrupólu (Quantiva) – analytický přístroj používaný pro kvantitativní stanovení léčiv a pesticidů ve vzorcích vod, pasivních vzorkovačů, půd, kalů a sedimentů |
 |
| Laboratoř řízené reprodukce a intenzivního chovu ryb (LRICH) |
| Experimentální recirkulační systém pro růstové testy na rybách. K dispozici je kompletně vybavený systém s modulárním uspořádáním. |
 |
| Samokrmítkový systém pro distribuci (dávkování přesných množství krmiv) krmiv a hodnocení počtu požadavků ryb na krmivo. Software umožňuje vytváření krmných protokolů a hodnocení potravního chování ryb. Software umožňuje kontrolu chovu ryb na třech úrovních (přehled o chovaných rybách, vývoj v reálném čase a detail každé chovné nádrže) |
 |
| Kompletní systém plavacích tunelů/ respirometrů pro počítačově asistovanou přerušovanou respirometrii. Systém umožnuje plně automatizované měření spotřeby kyslíku, hodnocení schopností plavání (Ucrit) ryb a chování ryb. Pro studie zaměřené na biomechaniku a fyziologii plavání v kombinaci s metabolickými a etologickými studiemi. |
 |
| Laboratoř experimentálních komplexních systémů (LEKS) |
| Laboratoř tkáňových kultur, sledování buněčné dynamiky živočišných buněk Laboratoř tkáňových kultur má téměř dvacetiletou tradici v servisním práci pro soukromá, klinická i univerzitní pracoviště. Zabývá se sledováním dynamiky savčích buněk v interakci s materiály užívanými v medicíně. |
 |
| Optické mikroskopy velmi vysokého rozlišení NanoTruth. Technologie NanoTruth využívá dlouho známé techniky, které je teprve díky soudobým technologiím možné uplatnit v praxi. K analýze dat využívá postupy diskrétní matematiky vyvinuté pracovníky laboratoře LEKS. Nové prototypy mikroskopů NanoTruth byly dokončeny v roce 2019 a jsou poslední fází před možnou průmyslovou výrobou. |
 |
| 5iD viewer - komplexní analýza chování hejn až na úroveň jedince a jeho role v hejnu. Sledovač 5iD viewer je první zařízení na světě, které umožňuje analyzovat hejnové chování ryb až na úroveň role jednotlivce. Klíčem jsou nové algoritmy, které umožňují identifikovat jedince a tím zabránit propagaci chyb. 5iD viewer se kromě základního výzkumu uplatní i v praxi medicínského výzkumu, kde umožní minimalizovat počet použitých testovacích zvířat, v praxi úpraven vod, ve veterinární praxi a v mnoha dalších aplikacích. |
 |
| Laboratoř fyziologie reprodukce (LFR) |
| Hodnocení kvality a pohyblivosti spermií (včetně pohybu bičíku) před a po kryokonzervaci. Nabízí několik mikroskopů připojených k digitálním a analogovým videokamerám, pokrývá různé kontrastní metody (BF, DF, PH), teplotní rozpětí (4-37°C), frekvenci snímků (5-5000 FPS), zvětšení (až x100) a rozlišení (až 3200x1800) během záznamů motility. |
 |
| Laboratoř vodní toxikologie a ichtyopatologie (LVTI) |
| Analýzu genové exprese a další biochemické analýzy. Přístrojové vybavení: Real-Time PCR cycler + Bioanalyzer + Nanodrop, Spektrofotometr s fluorescenčním a luminiscenčním modulem Infinite M200PRO (TECAN) + dvou paprskový spektrometr (SPECORD). |
 |
| Histopatologického vyšetření tkání vodních organizmů – je založené na kompletním zařízení pro přípravu a analýzu histologických preparátů tkání organizmů. Přístrojové vybavení: odvodňovací automat Histomaster (Model 2052/1,5), modulární zalévací parafínová linka (Leica EG1150), poloautomatický rotační mikrotom, automatická barvící linka (TISSUE-TEK® DRS™ 2000, SEKURA) a mikroskopem (MOTIC). |
 |
| Laboratoř molekulární, buněčné a kvantitativní genetiky (LMBKG) |
| Kapilárový automatický sekvenátor Applied Biosystems 3500 a sekvenátor nové generace Ion Torrent™ PGM pro sekvenování mitochondriálních a nukleárních genů. Sekvenace genů je používána především k přiřazení rodičovského páru, určení monosexních obsádek ryb a studiu vzájemného genetického a molekulárně biologického postavení populací ryb a korýšů. |
 |
| Průtokové cytometry Partec CCA-I a CyFlow® Cube 8 ke stanovení úrovně ploidie na základě zjištění relativního množství DNA v jádrech somatických buněk ryb, případně jejich gamet, obarvených DNA-specifickými barvivy. Další možností je stanovení počtu a koncentrace měřených částic. |
 |
| Laboratoř zárodečných buněk (LZB) |
| Zebrafish housing systém – poloautomatický systém na odchov malých druhů ryb a rozkrm larev |
 |
| Systém pro manipulaci a injikaci rybích embryí – systém je vhodný od prvních stádií po oplození až po larvální stádia. |
 |
| Analyzátor relativního obsahu DNA – uživatelsky přívětivý průtokový cytometr je vhodný pro hodnocení relativního obsahu DNA v jádrech buněk. |
 |
| Kapilárová elektroforéza – elektroforetický systém s rozlišením do třech bází je vhodný především pro přesnější stanovení velikosti PCR produktů. |
 |
| Laboratoř zpracování signálu a obrazu (LZSO) |
| Monitorovací systémy pro etologické studie ryb - založené na 3D kamerách umožňují automatizovaný záznam a vyhodnocení chování ryb v akváriích a nádržích |
 |
| Hyperspektrální kamera - Skenování a analýza vzorků pomocí hyperspektrální kamery, analýzy odrazivosti povrchu materiálů, které jsou posléze korelovány s obsahem látek či složením materiálu, typická úloha je analýza vzhledu ryb při použití různých diet, skenovací kamera umožňuje zpracování libovolných materiálů – viditelné + blízké infračervené spektrum |
 |
| Laboratoř výživy (LV) |
| Akvaponická hala obsahující 6 nezávislých recirkulačních akvakulturních systémů se sběrem odpadní vody a mineralizací kalů. 200 metrů čtverečních skleníku s čtyřmi typy (raftové, záplavové, kapénkové a aeroponické systémy) hydroponických systémů (každý min 6 opakování). |
 |
| Chromatografická laboratoř včetně přípravny vzorků pro komplexní analýzy krmiv, masa ryb, výkalů a dalších matric. Přístroje zastoupené v laboratoři jsou: GC-MS, HPLC, HPTLC, Maldi-tof. |
 |
| Plně vybavená zpracovna ryb pro výrobu a vývoj rybích výrobků (chlazené, mrazené, uzené, vařené, marinované), včetně analytického zázemí pro studium postmortálních změn v rybím mase a hodnocení kvality rybích výrobků |
 |
| Laboratoř sladkovodních ekosystémů (LSE) |
| EthoVision® XT set-up – etologický software s vybavením (hardware, kamerový systém, arény) v etologické laboratoři. Etologické sledování vodních živočichů a automatické vyhodnocování jejich životních projevů. Možnost sledování až 96 arén najednou. |
 |
| Simulátor průtočných podmínek pro ryby a raky. Umožňuje simulovat podmínky tekoucích vod pro experimentální sledování ryb a raků |
 |
| Akvarijní místnost. Slouží pro uchování a chov raků a pro provádění experimentů. |
 |
| Sestava inkubátorů ve velké laboratoři. Umožňuje uchování vodních organismů a provádění experiment v teplotně specifickém prostředí (4 – 40°C). |
 |
| Systém na detekci srdeční aktivity raků a mlžů. Umožňuje neinvazivní sledování srdeční aktivity raků a mlžů v laboratorních podmínkách. |
 |
| Prostory pro odchov a experimentální udržování ryb nebo raků (venkovní a vnitřní žlabovna). Slouží pro uchování a chov ryb a raků a pro provádění experimentů, jak v přírodních, tak kontrolovaných podmínkách (včetně možnosti recirkulace vody). |
 |
| DanioVision® set-up s příslušenstvím v samostatné laboratoři. Systém umožňující sledování vývoje a životních projevů (včetně srdeční aktivity) vodních organismů v období embryonálního a postembryonálního vývoje v řízených teplotních I světelných podmínkách. |
 |
| Odběr vzorků vody a hydrobiontů (ryby, zoobentos, zooplankton, fytoplankton) ve sladkých vodách (rybníky vč. přítoků, odtoků, tekoucí vody různého typu, mělká jezera) v ČR, měření základních fyzikálně- chemických parametrů vody, zpracování a analýza vzorků. |
 |
| Prostory pro ekologické a etologické sledování hydrobiontů, sledování potravního chování hydrobiontů (zejména ryb či makrozoobentosu), experimenty na zooplanktonu a fytoplanktonu, provádění pokusů a sledování na raných stádiích ryb, ověření účinnosti různých postupů nebo preparátů při umělé reprodukci ryb. |
 |
